Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3bO88509 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3bO88509 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms