Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnt1O88346 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms