Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nid2O88322 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nid2O88322 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nid2O88322 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nid2O88322 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms