Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtssO70370 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtssO70370 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtssO70370 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtssO70370 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtssO70370 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtssO70370 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtssO70370 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtssO70370 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtssO70370 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtssO70370 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtssO70370 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtssO70370 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtssO70370 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms