Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sigmar1O55242 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sigmar1O55242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms