Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx4O55187 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx4O55187 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms