Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bnip3O55003 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms