Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LatO54957 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LatO54957 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LatO54957 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LatO54957 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LatO54957 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LatO54957 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LatO54957 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LatO54957 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LatO54957 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LatO54957 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LatO54957 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms