Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms