Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EdaO54693 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EdaO54693 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EdaO54693 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EdaO54693 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EdaO54693 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EdaO54693 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EdaO54693 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EdaO54693 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EdaO54693 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EdaO54693 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EdaO54693 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EdaO54693 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EdaO54693 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EdaO54693 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms