Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdk5r2O35926 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms