Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited2O35740 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cited2O35740 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cited2O35740 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cited2O35740 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 422.8 ms