Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnnO35691 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnnO35691 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnnO35691 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnnO35691 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnnO35691 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnnO35691 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnnO35691 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PnnO35691 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnnO35691 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnnO35691 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnnO35691 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnnO35691 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnnO35691 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnnO35691 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms