Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1mwO35599 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Opn1mwO35599 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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