Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1aO35526 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx1aO35526 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx1aO35526 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms