Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TnxbO35452 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TnxbO35452 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TnxbO35452 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TnxbO35452 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TnxbO35452 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TnxbO35452 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TnxbO35452 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TnxbO35452 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TnxbO35452 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TnxbO35452 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TnxbO35452 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TnxbO35452 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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