Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd2O35392 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd2O35392 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms