Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad6O35182 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad6O35182 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms