Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casq1O09165 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casq1O09165 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms