Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sypl1O09117 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl1O09117 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms