Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sec22bO08547 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec22bO08547 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms