Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna4O08542 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna4O08542 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna4O08542 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna4O08542 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna4O08542 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna4O08542 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms