Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6871L7N248 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6871L7N248 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms