Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20878L7N244 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms