Protein–RNA interactions for Protein: L7N229

Gm4778, Predicted gene 4778, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4778L7N229 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm4778L7N229 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4778L7N229 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4778L7N229 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4778L7N229 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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