Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vwa3bJ9JI28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vwa3bJ9JI28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms