Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm21887J3QQ04 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms