Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2056J3QQ02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms