Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm3685J3QPP2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3685J3QPP2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms