Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9602J3QPD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9602J3QPD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms