Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2035J3QP87 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2035J3QP87 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms