Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21797J3QNW5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms