Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21972J3QN38 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms