Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
4930544D05RikJ3QK56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms