Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubgcp6G5E8P0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms