Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17lcG5E8I7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms