Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r67G5E8C1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms