Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms