Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ScaperF8VQ70 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms