Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp9yF8VPU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp9yF8VPU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.2 ms