Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LctF8VPT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LctF8VPT3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LctF8VPT3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms