Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms