Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17654F7AXR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17654F7AXR3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms