Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D430041D05RikF6ZGR6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms