Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pagr1bF6V0H0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1bF6V0H0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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