Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngap1F6SEU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngap1F6SEU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms