Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm1979E9QAN3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm1979E9QAN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms