Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms