Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms