Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcmdc2E9Q956 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms